Introduction

Le test de Student appari? permet de comparer les moyennes de deux s?ries de valeurs pr?sentant un lien.

Un format simplifi? de la fonction R ? utiliser est :

t.test(x, y, paired=TRUE)

x et y correspondent, respectivement, aux deux s?ries de valeurs ? comparer. Ce sont des vecteurs de type num?ric.

La fonction t.test est d?crite en d?tails ici.

Exemple de donn?es

10 souris ont re?u un traitement X grossissant pendant 3 mois. Leur poids a ?t? mesur? avant et apr?s traitement. Pour chaque souris on a donc deux valeurs (l?une avant et l?autre apr?s traitement).

Les donn?es sont pr?sent?es ci-dessous:

La question est de savoir si le poids des souris a significativement chang? apr?s les 3 mois de traitement?.

Il s?agit bien d?un test de Student appari? car les deux mesures ? comparer proviennent des m?me souris.

Calcul du test de Student non-appari? avec R

Le test de Student peut ?tre effectu? avec le code R suivant :

# Poids des souris avant traitement
x<-c(200.1, 190.9, 192.7, 213, 241.4, 196.9, 172.2, 185.5, 205.2, 193.7)
# Poids des souris apr?s traitement
y<-c(392.9, 393.2, 345.1, 393, 434, 427.9, 422, 383.9, 392.3, 352.2)
res<-t.test(x, y, paired=TRUE)
res

    Paired t-test
data:  x and y
t = -20.88, df = 9, p-value = 6.2e-09
alternative hypothesis: true difference in means is not equal to 0
95 percent confidence interval:
 -215.6 -173.4
sample estimates:
mean of the differences 
                 -194.5 

La p-value du test est de 6.2003 ? 10^-9. Ce qui est largement inf?rieur ? 0.05. On conclut que le poids moyen des souris avant traitement est significativement diff?rent de celui apr?s traitement avec une p-value = 6.2003 ? 10^-9.

Acceder aux valeurs retourn?es par la fonction t.test

Comme indiquer ici, on peut facilement acc?der aux valeurs retourn?es par la fonction t.test():

# Affichage de la p-value
res$p.value

[1] 6.2e-09

# Affichage de la moyenne
res$estimate

mean of the differences 
                 -194.5 

# Affichage de l'intervalle de confiance
res$conf.int

[1] -215.6 -173.4
attr(,"conf.level")
[1] 0.95

Test de Student non-appari? en ligne

Infos

Cette analyse a ?t? faite avec R (ver. 3.1.0).