Maxstat et courbe de survie pour une variable continue avec RQuery
Table des matières
Format du fichier
Le fichier accept? est au format .txt tabulation. Les variables sont en colonnes.
T?l?charger un exemple de fichier en cliquant ici
Enregistrer le fichier au format .txt tabulation.Les variables sont en colonne. Le fichier contient une colonne "ev?nement" appel?e ici event , une colonne "temps" appel?e ici "time" et 2 autres variables continues (gene1, gene2).
Pour en savoir plus sur le format de fichier accept? suivre le lien suivant : Importation et exportation des donn?es avec RQuery-1.0
Utilisation de la fonction rquery.maxstat
Maxstat et courbe de survie de la variable gene1
Code R :
rquery.maxstat(eventName="event", timeName="time", varName="GENE1")
La fonction prend comme param?tre:
- Le nom de la colonne contenant l’?v?nement (eventName="event")
- Le nom de la colonne contenant le temps (timeName="time")
- Le nom de la colonne contenant la variable d'int?r?t (varName="gene1")
R vous demandera d'indiquer le fichier contenant les donn?es. Indiquer le chemin du fichier que vous venez de t?l?charger.
Ci-dessous le graphique g?n?r?:
cliquez pour agrandir
La fonction cr?e un dossier Result/Maxstat contenant les fichiers g?n?r?s. Ce dossier inclue entre autres un fichier txt contenant les r?sultats de l'analyse maxstat pour chacune des variables interrog?es.
Maxstat et courbe de survie pour une liste de variable
Il suffit d'indiquer la liste dans le param?tre varName.
Code R :
res<-rquery.maxstat(eventName="event", timeName="time", varName=c( "GENE1", "GENE2"))
Dans ce cas un fichier pdf est g?n?r? contenant l'ensemble des graphique.
Cliquez ici pour voir un exemple de fichier pdf g?n?r?.
Un fichier .txt est ?galement g?n?r? : exemple
Utilisateur avanc?
rquery.maxstat
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