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R2DOCX : Cr?er un document word avec R

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    Deux possibilit?s pour g?n?rer un document word. Soit avec Knitr et pandoc ou avec R2DOCX.

    Pandoc : Convertir un document Markdown vers d'autres formats



    Pour plus de d?tails cliquez-ici

    La fonction pandoc() est incluse dans le package knitr (version 1.2) permettant de convertir des documents Markdown ? d'autres formats tels que Latex/PDF, HTML et word (.doc, .docx).

    Cette fonction permet juste d?ex?cuter de mani?re simple la ligne de commande suivante:
    Code R :
     
FILE <- "example"
system(paste0("pandoc -o ", FILE, ".docx ", FILE, ".md"))
 



    Pour le fichier.md, le chemin absolu est necessaire.
    Utilisez donc la commande :
    Code R :
     
commande<-paste("pandoc -o ",  "myfile.docx ", getwd(), "/myfile.md ", sep="")
system(commande)
 



    Pour installer pandoc suivre ce lien

    Utilisation simple

    Code R :
     
library(knitr)
pandoc('foo.md', format='html')  # HTML
pandoc('foo.md', format='latex') # LaTeX/PDF
pandoc('foo.md', format='docx')  # MS Word
pandoc('foo.md', format='odt')   # OpenDocument
 



    Cr?er un document word avec R2DOCX



    R2DOCX permet de cr?er, de mani?re simple, un document word ? partir d'un template ou pas, d'ins?rer des graphiques et des tables.

    Une documentation est compl?te est fournie ici
    Un exemple est montr? ici

    Installation



    Compatibilit? R >= 3.0

    Code R :
     
install.packages("devtools")
devtools::install_github('R2DOC', 'davidgohel')
devtools::install_github('R2DOCX', 'davidgohel')
 


    Pour les utilisateurs de Mac :

    Code R :
     
Sys.setenv(NOAWT=1) #prevents usage of awt.[http://cran.r-project.org/doc/manuals/r-devel/R-admin.html#Java-_0028OS-X_0029]
install.packages("devtools")
devtools::install_github('R2DOC', 'davidgohel')
devtools::install_github('R2DOCX', 'davidgohel')
 



    Les fonctions disponibles


    • addPlot pour ajouter un graphique.
    • addParagraph pour ajouter un paragraphe de textes
    • addTable pour ajouter des tables.
    • addHeader pour ajouter des titres.
    • addTOC pour ajouter une table des mati?res.
    • addPageBreak pour ajouter un saut de page.
    • addLineBreak pour ajouter un saut de ligne.
    • replaceText pour remplacer du texte.


    Votre premier document



    Code R :
     
Sys.setenv(NOAWT=1) #prevents usage of awt - required on Mac
library(R2DOCX)
# Nom du fichier ? cr?er
docx.file <- "document.docx"
# Objet Docx ? manipuler
doc <- new ("Docx", title = "My example" )
#ajouter une table
doc = addTable( doc, iris[1:10,] )
# Ajouter du texte
doc <- addParagraph( doc, value = "Hello World!", stylename = "Normal" )
# ajouter un graphique
doc = addPlot( doc, function() plot( rnorm(10), rnorm(10) )
               , width = 10, height = 8
)
# Ecriture du fichier 
writeDoc( doc, docx.file )
 


    Cr?er un document word ? partir d'un template


    Code R :
     
# document word ? cr?er
docx.file = "document.docx"
# Document word ? utiliser comme template
template.file = file.path( find.package("R2DOCX"), "templates/TEMPLATE_01.docx", fsep = "/" )
# Cr?er un nouveau objet
doc = new("Docx"
, title = "My example" 
, basefile = template.file
)
# Dans le document de base, 2 mots cl?s existent- Rempla?ons les
doc = replaceText( doc, pattern = "AUTHOR", replacement = "John Doe" )
doc = replaceText( doc, pattern = "DATE", replacement = date() )
 



    Titre principal



    Code R :
     
#Titre principale
#**************************************
doc = addParagraph( doc, value = "Exemple", stylename = "TitleDoc" )
doc = addPageBreak( doc ) #saut de page
 




    Table des mati?res



    Code R :
     
#Table des mati?re (table of content : TOC)
#**************************************
#On vous demandera de mettre ? jour la table de mati?res
#la pr?mi?re fois que le document sera ouvert
doc = addHeader(doc, "Table des mati?res", 1);
doc = addTOC(doc)
doc = addPageBreak( doc )#saut de page
 




    Ajout de textes (Normal et liste)



    Code R :
     
# Ajout de textes (normal and liste)
#**************************************
doc = addHeader(doc, "Dataset presentation", 1);
#texte normal
doc = addParagraph( doc, value = "Dataset 'measured.weights' is set of weights measurements collected on few people before savate training.", stylename = "Normal" )
#liste non ordonn?e
texts = c( "Column 'gender' is the subject gender." 
           , "Column 'id' is the unique subject identifier." 
           , "Column 'cat' is the subject weight category." 
           , "Column 'competitor' tells wether or not subject practice competition." 
           , "Column 'day' is the day of measurement." 
           , "Column 'weight' is the measured weight." 
)
doc = addParagraph( doc, value = texts, stylename = "BulletList" )
 




    Formatage conditionnel du texte



    La fonction addParagraph permet d'ajouter simplement du texte comme montr? ci-dessus. Elle peut ?galement ?tre utilis?e pour faire du remplacement de textes et du formatage conditionnel.

    Code R :
     
# template text
x = "[animal] eats [food]."
# define formatting properties for replacement text ? see chapter "styles"
textProp = textProperties( color = "blue" )
replacement.styles = list( animal= textProp, food= textProp )
# define replacement text
replacements = list( animal = "donkey", food = "grass" )
doc <- addParagraph( doc, value = x, stylename = "Normal"
                     , replacements = replacements
                     , replacement.styles = replacement.styles
)
 




    La fonction textProperties
    Code R :
    textProperties(color = "black", font.size = 10
, font.weight = "normal", font.style = "normal"
, font.family = "Arial" )


    color: couleur de la police; font.size: taille en pixel; font.weight : "normal" ou "bold"; font.style: "normal" ou "italic"; font.family: police.

    Ajouter une table



    Table simple:

    Code R :
     
# Ajouter une table
#**************************************
# Table utilisee
data( measured.weights )
doc = addHeader(doc, "Dataset", 1);
doc = addHeader(doc, "Dataset first lines", 2);
#Table simple
doc = addTable( doc
                , data = head( measured.weights, n = 10 )
                , formats = get.light.formats()
)
doc = addLineBreak( doc )#saut de ligne
 




    Renommer les ent?tes de la table:

    Avant d'avoir renomm? :

    Code R :
     
doc = addTable( doc, data = weights.summary)
 




    Apr?s avoir renomm? :

    Code R :
     
doc = addTable( doc
, data = weights.summary
, header.labels = list("id" = "Subject Identifier", "avg.weight" = "Average Weight"
, "regularity" = "Regularity", "visit.n" = "Number of visits", "last.day" = "Last visit"
) # columns labels to display
)
 




    Table simple personnalis?e avec fusion des lignes :

    Dans la table ci-dessous, les lignes sont fusionn?es sur la colonne 'day'. La colonne 'gender' est color?e en fonction du genre.

    Code R :
     
# simple addTable with row merging on 'day' column
doc = addHeader(doc, "Dataset last lines", 2);
sampledata = tail( measured.weights[ order(measured.weights$day), ], n = 20 )
doc = addTable( doc
, data = sampledata
, span.columns = c("day")
, col.colors = list( "gender" = ifelse( sampledata$gender == "male" , "#00c2ff", "#ffcdd1") )
)
 




    Table personnalis?e avec ent?tes group?es:

    Dans cette table les ent?tes ont ?t? renomm?es, des ent?tes group?es sont cr?es, le type des colonnes est pr?cis? (%, entier, caract?re, nombre d?cimal, date). Les valeurs de la colonne "Regularity" ont ?t? color?es en fonction de la valeur (couleur grise si < 0.5 et bleu si >= 0.5).

    Code R :
     
# customized table
doc = addHeader(doc, "Dataset summary", 1);
doc = addTable( doc
, data = weights.summary
, header.labels = list("id" = "Subject Identifier", "avg.weight" = "Average Weight"
, "regularity" = "Regularity", "visit.n" = "Number of visits", "last.day" = "Last visit"
) # columns labels to display
, grouped.cols=list( "id" = "id"
, "Summary" = c( "avg.weight",  "regularity", "visit.n", "last.day" ) 
) # grouped headers line to add before headers line
, col.types = list( "id" = "character", "avg.weight" = "double"
, "regularity" = "percent", "visit.n" = "integer"
, "last.day" = "date" ) # reporting types of each columns 
, col.fontcolors = list( "regularity" = ifelse( weights.summary$regularity < 0.5 , "gray", "blue") ) # customized font colors for column "regularity"
)
 




    Ajouter un graphique



    Code R :
     
# Ajouter un grahique
#**************************************
doc = addPageBreak( doc )
doc = addHeader(doc, "Graphics", 1);
doc = addPlot( doc,
               function() boxplot(measured.weights$weight ~ measured.weights$id,
                                  xlab = "Subjects", ylab = "Weights" , col = "#0088cc",
                                  legend = "My boxplot"),
               width=7, height=7
              )
 




    Remplacement de texte



    Pour remplacer le mot cl? "AUTHOR", dans le document word, avec "Pearson" :

    Code R :
     
doc = replaceText( doc, "AUTHOR", "Pearson")
 


    Les styles de titres disponibles dans votre document



    Code R :
     
doc <- new("Docx", title = "My example" )
styles( doc )
# [1] "Normal"                  "Titre1"                  "Titre2"                 
# [4] "Titre3"                  "Titre4"                  "Titre5"                 
# [7] "Titre6"                  "Titre7"                  "Titre8"                 
#[10] "Titre9"                  "Policepardfaut"          "TableauNormal"          
# ...
doc <- setHeaderStyle(doc, stylenames = c("Titre1", "Titre2", "Titre3", "Titre4", "Titre5", "Titre6", "Titre7", "Titre8", "Titre9" ) ) 
doc = addHeader( doc, "title 1", 1 )
 



    Un document word complet



    Le script complet utilis? pour cr?e le document word suivant est t?l?chargeable ici : R2DOCX.r

    Document word complet

    Voir Aussi



    R2XLSX : lire, ?crire et formater un document Excel dans R
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