Installation du package samr
SAM (Significance Analysis of Microarrays) est une m?thode statistique pour identifier des g?nes diff?rentiellement exprim?s en utilisant des puces ? ADN.
Pour voir le site officiel cliquez ici
Pour utiliser SAM dans R, il faut installer le package samr :
Code R :
Le package samr depend du package 'inpute' qui ne peut plus ?tre installer directement ? partir de la console R (version R 2.15.1).
Le package inpute est disponible ? partir du site Bioconductor
Pour installer le package inpute, utiliser le code suivant dans R :
Code R :
Pour voir le site officiel cliquez ici
Pour utiliser SAM dans R, il faut installer le package samr :
Code R :
install.packages('samr')
Le package samr depend du package 'inpute' qui ne peut plus ?tre installer directement ? partir de la console R (version R 2.15.1).
Le package inpute est disponible ? partir du site Bioconductor
Pour installer le package inpute, utiliser le code suivant dans R :
Code R :
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("impute")