Articles - R

Installation du package samr

  |   1182  |  Poster commentaire  |  R
SAM (Significance Analysis of Microarrays) est une m?thode statistique pour identifier des g?nes diff?rentiellement exprim?s en utilisant des puces ? ADN.

Pour voir le site officiel cliquez ici

Pour utiliser SAM dans R, il faut installer le package samr :

Code R :
 
install.packages('samr')
 


Le package samr depend du package 'inpute' qui ne peut plus ?tre installer directement ? partir de la console R (version R 2.15.1).

Le package inpute est disponible ? partir du site Bioconductor

Pour installer le package inpute, utiliser le code suivant dans R :

Code R :
 
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("impute")
 

Licence - Pas d?Utilisation Commerciale - Partage dans les M?mes Conditions
Licence Creative Commons