ANOVA : Analyse de variance avec R

L'ANOVA permet de voir si une variable num?rique a des valeurs diff?rentes en fonction de plusieurs groupes. C'est une g?n?ralisation du test de Student permettant de comparer plus de deux groupes.


La commande ? utiliser est :

Code R :
 
fit <- aov(y ~ A, data=mydataframe) # y est la variable num?rique et A indique les groupes
summary(fit)
 


Exemple :

Code R :
 
fr <- data.frame(var = c(10, 4, 5, 3, 3, 7, 2, 6, 2, 8, 5),
                 group = factor(c("c", "a", "b", "a", "b", "b", "a", "b", "a", "c", "c")))#table de donn?es
fit <- aov(var ~ group, fr)# analyse de variance
summary(fit)
 



R?sultat de la commande:

            Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
group        2 41.833 20.9167  6.9241 0.01798 *
Residuals    8 24.167  3.0208                  
---
Signif. codes:  0 ?***? 0.001 ?**? 0.01 ?*? 0.05 ?.? 0.1 ? ? 1


Le test renvoie une p-value significative; p = 0.018.

Dans le cas d'un test d' ANOVA, m?me si le test est significatif, on ne sait par contre pas quelles cat?gories sont concern?es. Il faudra donc faire un test de Student pour comparer les groupes 2 par 2.



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